S'ha d'optar pel RETA o per Mutual Mèdica des de la comunicació a Hisenda de l'inici de lactivitat professional per compte propi. Si, en aquell moment, no s'ha manifestat expressament una decisió, l'Administració de la Seguretat Social entendrà el metge s'ha acollit al RETA. Un cop inscrit en el RETA, ja no podrà acollir-se a l'alternativa autònoms en tota la seva trajectòria professional en l'exercici per compte propi; en canvi, si opta per Mutual Mèdica, sempre podrà donar-se d'alta al RETA si li interessa més endavant.

Els socis de societats professionals constituïdes per a l'exercici comú de l'activitat mèdica podran optar per Mutual Mèdica, a través de l'Assegurança del Metge Exercici Lliure (MEL), com a alternativa a l'alta en el Règim Especial de Treballadors Autònoms, sempre que es compleixin determinats requisits. La societat ha de tenir la forma jurídica de societat professional i el càrrec d'administrador no ha de ser retribuït; a més, el seu objecte social ha de ser únicament i exclusivament mèdic.

La normativa i la casuística són complexes en el cas de socis que exerceixen, també, càrrec d'administrador de la societat; en aquests casos convé consultar un assessor especialitzat de Mutual Mèdica.

El MEL està format per una sèrie d'assegurances de contractació obligada per a poder cobrir l'exercici per compte propi amb l'alternativa al RETA. No obstant això, en el moment de la contractació de l'assegurança del Metge d'Exercici Lliure (MEL) -o posteriorment-, el metge pot ampliar les cobertures de les assegurances que s'adaptin més bé a la seva situació personal i professional, i aconseguir així una cobertura a mida, cosa que no passa amb el Règim Especial de Treballadors Autònoms (RETA), que obliga a incrementar totes les cobertures per igual, sense oferir la possibilitat d'ajustar-les en funció de les necessitats i preferències del metge.